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2014-04-26 23:31 来源:http://www.ceo315.org/ 阅读: 次继承选择原“热门”方向,就需要和全球许多学者抢时间,抢成果,抢机会。即便有一定成果,还会有与别人成果反复,经费不足,论文发表难题等危险,整体竞争压力大,反而抑制了研究的“健康”进行。
处理海量的数据,需要的不仅是技巧和耐烦,还需要有如破案的灵敏度。“整个过程需要大批的统计知识和庞杂的数学盘算,最难的是把这些数字转化成一个证据确实的故事。”杨云锋用这样的语言来形容:我们是侦察,来到了一个凶案现场,看到的是一堆陈迹,如刀、血迹、混乱的物品……从这些线索中回推还原当时的情况,推断整个案情产生的过程。良多时候须要猜想,而且会还原好几个故事,甚至因为现场不可逆性而无奈判断哪个才是本相。因为气候变化快,所有的采集的数据也是不可逆转的,所以在对数据结果进行确破和判定时,要参考前人的结果,并作出理智的决议判断。杨云锋也对此有着本人的信念,“我们的上风是断定力强,见多识广,灵感多。”
游手好闲,侦破“案情”,还原“故事”
审时度势,在“冷门”中追求“热门”
这次关于青藏高原草原微生物功能多样性的课题真正开始于杨云锋回国之前。在国外,他通过配合者提供的样品进行了一系列实验,比如测试微生物在基因层面上调控碳、氮循环的机制等。最终这些实验结果通过数字的变化出现,而如何把这些数字用最优地情势表白出来,并让人佩服则是这项课题最重要也最要害的一步。回国时,杨云锋带回来了一张包括几十万个数据的excel表,并领导高莹开始分析。
当然,这些研究的利用价值目前并不明显,还需要进行大量的工作。杨云锋也提到这次的论文只是他们整个综合名目中的一篇,他们也会陆续开展系列研究。课题组当初自己采样,做实验,主要实验包含对微生物DNA提取,测序,取得基因信息;测定温室气体通量等。这些工作将丰盛环境微生物领域的研究基本,对宏观现象给予解释,并为国度的决策供给一定的参考根据。
杨云锋在经由三思而行后,终于决议博士毕业后改变自己的研究方向——从医学微生物转到了环境微生物,从“热点”跳到“冷门”。而跟着全球环境问题一直,环境掩护成为国际话题,环境微生物研究逐步受到关注。明智的取舍让杨云锋较早地跨入了这个主流领域,并找到了自己的兴趣所在。目前他课题组的工作主要是利用环境基因组学技术等来研究在全球变化的条件下,环境微生物的响应以及全球变化对微生物功能的影响。简略地说,就是研究微生物对全球变化的反馈机制。
“这个论文过程很长,处理数据用了一年,写文章,改文章又花了一年。”她总结,“面对拒稿不能气馁,刻薄的评审们在辅助你找新的思路。一定要坚持住,并不断完美自己构思。”
森林、草原、农田等生态体系排放出来的温室气体,是全球温室气体排放的主要形成。而这些温室气体,很大一局部是由微生物排放的。而所谓生物多样性,90%以上的生物多样性是微生物多样性。如今,我国利用微生物实现低碳减排的运用、微生物资源保护已经起步,好比克制草原、农田等生态系统温室气体排放已有一些治理办法。
同时他也盼望,“青年学生应当防止功利心,而是保持自己的兴致和幻想。做自己信任的事件,不被别人烦扰,让自己的生涯有意思。”
2013年8月29日,清华大学环境学院杨云锋研究组在《天然》旗下的The ISME Journal(国际微生物生态学会会刊)发表题为《青藏高原草原沿海拔梯度的微生物功能多样性》(The microbial gene diversity along an elevation gradient of the Tibetan grassland)的研究论文,首次实现了对青藏高原微生物功能多样性的调查,发现了其与环境前提、特殊是土壤氮循环之间的强烈相关性。
她刚进入课题组时面对这一堆数据,无论是专业常识仍是数据处理软件上,都存在不足,压力十分大。但艰苦重重的现状并没有打垮她,她通过书籍、材料、身边的老师同学,一步一步探索,匆匆找到了研究的方法。最先要做的是对几种数据前处置方法进行对照剖析,每种办法得到的成果有差别,但各有其生态学意思,找准综合较好的前处理方法是第一步。随后是进一步分析每一个基因的碳氮循环等过程,并用图表将其表征出来。
演绎地说,杨云锋课题组主要关注了两方面的问题:气候变化如何影响微生物多样性以及微生物排放温室气体的规律和影响,有助于人类对微生物质源进行维护和开发以及调控做作界的温室气体排放,保持环境可连续发展。
研通社记者 陈陆淼杜林霏 周格格
编纂:襄桦
记者走进清华大学环境学院专访了杨云峰和他的团队,凝听一群求知者对这个领域摸索的故事。
知人善用,施展团队最大能动性
“不同的工作需要不一样的学生,比方有些工作需要在本地采样,男生更合适,必定要勤勤奋恳,能刻苦刻苦,敢于去艰难的处所。又如有些工作需要从数据看问题,因此要的是爱好研究,有好奇心,乐意思考的学生。”总之,不同特点和优点的学生在一起,能够各司其职,人尽其才,让整个团队发挥最大的作用,政府师资。
杨云锋在和学生独特工作中也有不少难忘的阅历。他提到一次带学生去青海海北站取研究样本令人记忆深入。第一次去西藏,亲自领会到了那里艰苦的环境,吃住条件都无比不好,3个人一起一周竟然才花了70元。然而他回想,固然他和学生都感到那几天很苦,但是他们也感触了科研精力的力气,因为在那里他们看到长期驻留的研究者为了取样,可能要一天24小时都在工作,或者在野外考核,时刻面对深谷上暗藏的陷阱等等。
这次论文的第二作者,2011级博士生高莹先容全部组每周都会开组会,每个人轮流用英语讲;平时也随时探讨,有问题即刻解决不拖拉;每周要写讲演汇报工作情形。“咱们每一天节奏很紧凑,工作多,因而团队里从老师到学生每个人都很勤恳跟尽力,根本天天都有十多少个小时的科研时间。”她还提到,不仅和身边的同窗常常探讨,和老师也时常交换。有一段时光她做实验,始终不能实现预期的目的,杨老师就陪她在实验室重做实验,最后终于发现是试验设计的问题。
在这里他开端带着一群学生开始对于青藏高原微生物功能多样性的课题。
杨云峰研究组:侦探“世界屋脊”,开启环境微生物范畴研究新思路
图为青藏高原微生物群落构造与环境因子之间的强烈关系。
青藏高原是全球气候变化的敏感地区,在从前三十年里升温是世界平均程度的两倍,影响到了周边二十多亿国民的生活。该文的研究表明,气候变化会改变土壤微生物群落结构和温室气体排放,因此相关模型需要纳入微生物因素,才干正确猜测这一地区将来的气候变化。
继2013年1月份在全球变化主流杂志Global Change Biology(寰球变化生物学)道了放牧对青藏高原草原泥土微生物的影响之后,杨云锋引导的研究团队考察了青藏高原草原微生物功能多样性,应用时空调换的生态学方式,发明低温对土壤微生物构成显明的环境压力。天气变化对土壤氮循环影响显著,参加氨化、硝化进程的功效基因与氧化亚氮的排放存在正相干性,而对碳轮回影响不大。从而说明了青藏高原迥异与世界其它地域的一个特色,就是气象变更的影响主要不是表示在碳库上,而是在氨氮等动物成长的基础因素上。微生物功能基因的变化,是这个景象的微观机制。
青藏高原高寒草甸约占青藏高原面积的三分之一,是一种典范的地舆类型。由于适度放牧和全球暖化等因素的影响,近年来,青藏高原草原呈现了明显的变化。因此有必要对其可持续性发展做相关研究。同时,青藏高原上动植物、微生物等品种丰硕,而针对微生物的研究未几。杨云锋看到了青藏高原的价值,于是他又一次精确地选择了详细的研究对象。
青藏高原,中国最大、世界海拔最高的高原,总面积近300万平方公里,均匀海拔4000~5000米,有“世界屋脊”和“第三极”之称。是亚洲很多大河的发祥地。
“我喜欢这种状况,茶不思饭不想,最后恍然大悟的感到。这种对好奇心的满意是任何财产都替换不了的。”杨云锋生机自己的学生也能有这样的好奇心。因为故事的“难以还原”,学生一定要有自主的立异性,而且喜欢揣摩,头脑一直在运行,吃饭洗澡都在思考。
现在浮现在读者面前的是一张张美丽的图表。杨云锋指着论文中的图介绍,这些都是在统计学上有明显意义的结果,它们从定性和定量两个角度明白地表明了研究成果。
而高莹面对详细的数据时又是怎样的情况呢?
这也让人好奇,杨云锋组建了怎么一支研究步队。
这样一个多样化的团队总会产生很多故事,在研究过程中,他们树立了“同甘苦,共患难”的战友谊。
“研以至用”,开拓微生物研究新路
(清华消息网2月8日电)
2010年,一直期待回国发展的杨云锋在留美十多年之后回到祖国,在清华大学环境学院开办环境基因组学团队。国家、学校和学院对他的工作给予了鼎力的支撑,提供了良好的条件和资源,这也动摇了杨云锋的在科研方面勇敢开辟的信心。虽是下车伊始,却也有一种强烈的归属感。
相反,抉择绝对“冷门”的方向存在一定的优势。由于“冷门”领域关注较少,进而未解决的问题较多;各方面竞争压力小,便于真正发展翻新性研究。
针对一个大领域,要选择怎样一个切入点进行研究?这又是杨云锋需要思考的下一个问题。
“在研究生口试时,你会挑选怎样的学生参加您的团队呢?”
杨云锋本科从中国科大毕业后即在美国持续深造,在国外共做学术研讨14年。在纽约读博期间,他重要做癌症方向的医学微生物研究。虽小有成绩但仿佛不激发动他心坎最大的热忱。
缓缓地她找到了杨老师所描写的科研的快活,边学边做,数据处理、寻找法则、编写故事,许多的灵感也在一边写文章一边看论文中发生。
“我们愿望我们的研究成果终极也能为人类所用,并增进人类的发展。”杨云锋提出了自己的等待。
转变现状,寻找自己真正感兴趣而且相信的方向!当时的杨云锋思考着这样一个问题。
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